O Plano Diretor do Colégio São Luís teve como um dos objetivos a integração da arquitetura educacional aos princípios do projeto pedagógico implantado, bem como a reorganização dos setores com o propósito de acomodar o ensino em período integral.
Foram implantados, considerando o menor impacto nas atividades educacionais contínuas: Laboratórios Didáticos, Espaço Criança – Recepção e Convívio da Educação Infantil, Cantina e Refeitórios, Salas de Cursos Extras e Salas de Aula do Ensino Fundamental I. Todos os projetos receberam condicionamento de conforto térmico, acústico e luminotécnico, integrados à nova linguagem arquitetônica implantada, visando uma experiência completamente nova para os alunos e a comunidade acadêmica.
